SMK Muhammadiyah 3 Surakarta didirikan pada awal Tahun Ajaran 1996/1997 dengan nama : STM Muhammadiyah 2 Surakarta atas permohonan dari Pimpinan Daerah Muhammadiyah Majlis Pendidikan Dasar dan Menengah Kotamadya Surakarta dengan suratnya tertanggal 26 Desember 1995 Nomor: IIIA/4.a/583/XII/1995.
STM Muhammadiyah 2 Surakarta diberi Surat Tanda Terdaftar Tanggal 01 Juni 1996 Nomor: IIIA/6B/299/VI/1996.
SMK Muhammadiyah 3 Surakarta yang semula bernama STM Muhammadiyah 2 Surakarta menerima Surat Keputusan Persetujuan Pendirian / Penyelenggaraan Sekolah Swasta dari Kepala Kantor Wilayah Departemen Pendidikan dan Kebudayaan Propinsi Jawa Tengah dengan nomor : 738/I03/I/1996 Tanggal 03 Juni 1996. Terhitung mulai tanggal 01 Juni 1996 / Awal Tahun ajaran 1996/1997 Lokasi sekolah di jalan Prof. DR. Supomo No. 51 Kecamatan Banjarsari Kotamadia Surakarta Telp. (0271)716088 kode pos 57139, menempati bekas SMU Muhammadiyah 9 Surakarta yang dilikuidasi pada akhir tahun ajaran 1995/1996. Karena kekurangan siswa Pimpinan Sekolah diserahkan kepada Drs. Edy Siyamto sedang Wakil Kepala Sekolah Drs. Achmad Muzakir STM Muhammadiyah 02 Surakarta membuka dua jurusan : Program Studi Elektronika Komunikasi dan Program Studi Listrik Pemakaian
Pada awal Tahun Ajaran 1996/1997 mulai menerima pendaftaran siswa baru dengan melibatkan sebagian /beberapa orang karyawan SMU Muhammadiyah 9 sebagai panitia:
- Tahun I 1996/1997 Jumlah pendaftar 200 orang Yang diterima 144 orang 4 kelas
- Tahun II 1997/1998 Jumlah pendaftar 315 orang Yang diterima 160 orang 4 kelas
- Tahun III 1998/1999 Jumlah pendaftar 273 orang Yang diterima 160 orang 4 kelas
- Tahun IV 1999/2000 Jumlah pendaftar 249 orang Yang diterima 160 orang 4 kelas
- Tahun V 2000/2001 Jumlah pendaftar 261 orang Yang diterima 154 orang 4 kelas
- Tahun VI 2001/2002 Jumlah pendaftar 218 orang Yang diterima 134 orang 4 kelas
- Tahun VII 2002/2003 Jumlah pendaftar 211 orang Yang diterima 168 orang 4 kelas
- Tahun VIII 2003/2004 Jumlah pendaftar 201 orang Yang diterima 159 orang 4 kelas
- Tahun IX 2004/2005 Jumlah pendaftar 179 orang Yang diterima 152 orang 4 kelas
- Tahun X 2005/2006 Jumlah pendaftar 150 orang Yang diterima 117 orang 4 kelas
- Tahun XI 2006/2007 Jumlah pendaftar 237 orang Yang diterima 203 orang 5 kelas
- Tahun XII 2007/2008 Jumlah pendaftar 269 orang Yang diterima 206 orang 5 kelas
- Tahun XIII 2008/2009 Jumlah pendaftar 246 orang Yang diterima 180 orang 5 kelas
- Tahun XIV 2009/2010 Jumlah pendaftar 247 orang Yang diterima 193 orang 5 kelas
Nomor Data Sekolah SMK Muhammadiyah 3 Surakarta diberikan atas permohonan dari sekolah dengan surat tertanggal: 24 Januari 1998 Nomor: 18/I03.51.SMKM03/MN/1998
Nomor Data Sekolah (NDS) : 4203350030
Nomor Statistik Sekolah (NSS) : 32 2 03.61.05.015 diberikan oleh Kepala Kantor Departemen Pendidikan dan Kebudayaan Kotamadia Surakarta
SMK Muhammadiyah 3 Surakarta mulai Tahun Ajaran 1998/1999 sudah mempunyai Kelas III yang dapat diikut sertakan untuk menempuh EBTA/EBTANAS dan menginduk ke SMK Negeri 2 Surakarta. Jumlah Peserta: 122 orang dan berhasil lulus sebanyak 121 orang. Dari 121 orang yang lulus, 9 orang telah berhasil mendapatkan pekerjaan sebagian melanjutkan ke Perguruan Tinggi.
Setelah memasuki Tahun ke Empat(4) SMK Muhammadiyah 3 Surakarta mengajukan permohonan untuk di Akreditasi ke Kantor Wilayah Departemen Pendidikan dan Kebudayaan Propinsi Jawa Tengah Semarang dengan Surat tertanggal: 03 Nopember 1999 Nomor: 122/103.51.SMKM03/PR/1999.
Pelaksanaan Akreditasi pada Hari Rabu Tanggal 08 Desember 1999 dari jam 08.00 – 12.00 berjalan lancar. Hasil Akreditasi telah diterima dengan standar “DIAKUI”
SMK Muhammadiyah 3 Surakarta bekerja sama dengan Departemen Tenaga Kerja membentuk BKK (Bursa Kerja Khusus) Atas permohonan dari sekolah dengan surat tertanggal 01 Oktober 1999 Nomor Surat: 109/I03.51.SMKM03/MN/1999. Berdasarkan Surat Keputusan Direktur Jendral Pembinaan dan Penempatan Tenaga Kerja Kotamadia Surakarta Propinsi Jawa Tengah mengeluarkan Surat Persetujuan Nomor: B.1756/W.10/K.7/BKK/1999 Tanggal 15 Nopember 1999 Tentang Berdirinya BKK – Dengan Penanggung jawab/ Pimpinan BKK Wiwik Wahyuningsih, S.Psi- SMK Muhammadiyah 3 Surakarta serta dengan Institusi pasangannya.
Proses jalannya pendidikan (Kegiatan Belajar Mengajar) tahun ke tahun alhamdulillah selalu adanya peningkatan kwalitas. Dan kurang lebih pertengahan tahun 2006 adanya pelaksanaan Akreditasi ke dua dan hasil Sertifikatnya baik Program Keahlian Teknik Audio Video (TAV) maupun Teknik Listrik Pemakaian (TLP) berpredikat “A”
Selanjutnya pelaksanaan Akreditasi Ketiga akan dilaksanakan Tahun 2010 ini
Demikian sejarah singkat SMK Muhammadiyah 3 Surakarta sejak berdiri: 01 Juni 1996 hingga Sekarang Tahun 2010